微卫星

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20世纪80年代后期,Marshfield医学研究基金会(Marshfield Medical Research Foundation)的James和俄勒冈健康科学大学(Oregon Health Sciences University )的Wis等人分离出来一种比小卫星DNA具有更短重复单元的卫星DNA,被称为微卫星DNA,又被称作短串连重复(Short Tandem Repeats, STRs)或简单重复序列(Simple Sequence Repeat, SSRs), 每单元长度在1~6bp之间根据重复单元的构成与分布,微卫星DNA序列被分为3种类型:单一型(pure),复合型(compound)和间断型(interrupted)
中文名
微卫星
单一型
ATATATATATATATATATATATAT
复合型
 ATATATCACACACACACACAC
间断型
ATATATCA ATATATCA ATATATA

微卫星微卫星 Microsatellite

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基因组中一段简单重复序列, 例如:
单一型:ATATATATATATATATATATATAT
复合型: ATATATCACACACACACACAC
间断型: ATATATCA ATATATCA ATATATA
微卫星DNA符合孟德尔遗传模式,共显性表达,广泛分布于真核生物的基因组中,包括编码区和非编码区.研究表明,可能是DNA复制过程中的“链滑”(strand slippage)现象造成微卫星DNA多态性信息容量(polymorphic information content, PIC)较高.由于微卫星具有数量多、在基因组内分布均匀、多态性信息丰富、易于检测等优点被作为优良的遗传标记(genetic marker)而得到广泛应用。

微卫星基序 Motif

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微卫星中重复单元(Motif)。例如ATATATATATATATATATATATAT序列中,AT就是该序列的重复单元,在重复单元的划分上,一般认为:
CA = AC = GT = TG
AGC = GCA = CAG = GCT = CTG = TGC
[1] 
参考资料
  • 1.    Charles L. Ross et al.Rapid Divergence of Microsatellite Abundance Among Species of Drosophila:Molecular Biology and Evolution,2003:1143–1157
词条标签:
理学 医学人物 医学